До складу Управління фітосанітарної безпеки входять 5 відділів:

• Відділ фітосанітарних заходів на кордоні;
• Відділ карантину рослин;
• Відділ контролю за обігом засобів захисту рослин;
• Відділ прогнозування, фітосанітарної діагностики та аналізу ризиків;
• Відділ нагляду в насінництві та розсадництві.

Основними завданнями управління фітосанітарної безпеки є:

• охорона території області від занесення або самостійного проникнення з-за кордону або з карантинної зони карантинних об’єктів, здійснення контролю за додержанням законодавства про карантин рослин, у т. ч. при вивезенні та ввезенні з-за кордону насіння, рослин і продукції рослинного походження;
• інспектування та проведення фітосанітарної експертизи з видачею фітосанітарних та карантинних сертифікатів; здійснення державного контролю за проведенням фітосанітарних заходів що застосовуються до карантинних організмів відповідно до закону та міжнародних договорів України;
• контроль за виконанням порядку вимог та умов проведення знезараження об’єктів регулювання, які переміщуються через державний кордон України та межі карантинної зони підприємствами, установами та організаціями незалежно від форм власності; здійснення ведення обліку і видання інформації щодо поширення карантинних організмів;
• проведення фітосанітарної експертизи об’єктів регулювання; здійснення термінових заходів для локалізації та/або ліквідації карантинних організмів;
• організація і проведення систематичних обстежень земель сільськогосподарського призначення і земель лісового фонду, пунктів карантину рослин та прилеглої до них території, місць обігу рослин, продуктів рослинного походження та інших об’єктів регулювання, тощо;
• нагляд за розвитком, поширенням і шкодочинністю шкідливих організмів та розроблення разом із науково-дослідними установами прогнозів розвитку і поширення шкідливих організмів;
• державний контроль за своєчасним проведенням підприємствами, установами, організаціями усіх форм власності та громадянами заходів щодо захисту рослин, додержанням регламентів зберігання, транспортування, торгівлі та застосування засобів захисту рослин;
• поширення серед громадян інформації у сфері карантину та захисту рослин;
• державний контроль за діяльністю суб’єктів усіх форм власності і господарювання у сфері насінництва та розсадництва, включаючи квітково-декоративне насінництво та розсадництво, насінництво картоплі, овочевих, баштанних, плодових і горіхоплідних культур та розсадництво плодових, ягідних, горіхоплідних культур, винограду та хмелю, садівництва які займаються виробництвом, заготівлею, обробкою, розмноженням, зберіганням, реалізацією і використанням насіння та садивного матеріалу рослин, а також за умовами будь якого іншого використання насіння і садивного матеріалу.

Стратегічним  завданням  служби   є   забезпечення   фітосанітарної   безпеки   та   виконання      міжнародних обов’язків держави.

Головне управління Держпродспоживслужби в Чернівецькій області на даний час співпрацює з 1601 суб’єктами господарювання, які здійснюють господарську діяльність, пов’язану з виробництвом та обігом об’єктів регулювання та отримують фітосанітарні послуги.

В області зареєстровано 19 деревообробних підприємств які відповідають фітосанітарним вимогам і здійснюють обробку деревини та дерев’яної тари.

В період вегетації рослин під постійним контролем фахівців управління знаходяться посіви сільськогосподарських культур та багаторічних насаджень з яких продукція вивозиться на експорт та в інші регіони країни. Перед відвантаженням об’єктів регулювання проводиться лабораторний аналіз та визначення їх фітосанітарного стану, адже продукція з області відвантажується в 23 країни світу.

Під постійним контролем спеціалістів внутрішнього карантину знаходиться імпортна продукція, яка поступає більш як із 30 країн світу. Особлива увага приділяється насіннєвому та посадковому матеріалу.

Спеціалістами Управління постійно проводяться обстеження по встановленню фітосанітарного стану області.

Одним з важливих напрямків діяльності Управління фітосанітарної безпеки є робота зі зверненнями громадян. Особлива увага приділяється  забезпеченню оперативного реагування та надання відповідей на запитання, з якими громадяни звертаються до державного органу.