До складу Управління фітосанітарної безпеки входять 4 відділи:

• Відділ фітосанітарних заходів на кордоні;
• Відділ карантину рослин;
• Відділ захисту рослин, фітосанітарної діагностики та прогнозування;
• Відділ контролю у сфері насінництва, розсадництва та якості зерна.

Основними завданнями управління фітосанітарної безпеки є:

• забезпечення реалізації державної політики у сфері державного нагляду (контролю) у сферах карантину та захисту рослин,
  насінництва та розсадництва, охорони прав на сорти рослин та контролю за якістю зерна та продуктів його переробки;
• охорона території області від занесення або самостійного проникнення з-за кордону або з карантинної зони карантинних об’єктів, здійснення контролю за додержанням законодавства про карантин рослин, у т. ч. при вивезенні та ввезенні з-за кордону насіння, рослин і продукції рослинного походження;
• інспектування та проведення фітосанітарної експертизи з видачею фітосанітарних та карантинних сертифікатів; здійснення державного контролю за проведенням фітосанітарних заходів що застосовуються до карантинних організмів відповідно до закону та міжнародних договорів України;
• контроль за виконанням порядку вимог та умов проведення знезараження об’єктів регулювання, які переміщуються через державний кордон України та межі карантинної зони підприємствами, установами та організаціями незалежно від форм власності; здійснення ведення обліку і видання інформації щодо поширення карантинних організмів;
• проведення фітосанітарної експертизи об’єктів регулювання; здійснення термінових заходів для локалізації та/або ліквідації карантинних організмів;
• організація і проведення систематичних обстежень земель сільськогосподарського призначення і земель лісового фонду, пунктів карантину рослин та прилеглої до них території, місць обігу рослин, продуктів рослинного походження та інших об’єктів регулювання, тощо;
• нагляд за розвитком, поширенням і шкодочинністю шкідливих організмів та розроблення разом із науково-дослідними установами прогнозів розвитку і поширення шкідливих організмів;
• державний контроль за своєчасним проведенням підприємствами, установами, організаціями усіх форм власності та громадянами заходів щодо захисту рослин, додержанням регламентів зберігання, транспортування, торгівлі та застосування засобів захисту рослин;
• поширення серед громадян інформації у сферах карантину, захисту рослин, насінництва та розсадництва, охорони прав на сорти рослин та контролю за якістю зерна та продуктів його переробки;
• забезпечення проведення державного нагляду (контролю) щодо дотримання суб’єктами господарювання вимог законодавства у сферах насінництва та розсадництва,
  охорони прав на сорти рослин та контролю за якістю зерна та продуктів його переробки;
• здійснення нагляду (контролю) за діяльністю суб’єктів усіх форм власності і господарювання у сфері насінництва та розсадництва, садівництва;
• здійснення нагляду (контролю) за дотриманням сортових та посівних якостей насіння, що реалізується суб’єктами оптової та роздрібної торгівлі;
• здійснення нагляду (контролю) за обігом насіння і садивного матеріалу;
• здійснення нагляду (контролю) за дотриманням заходів біологічної і генетичної безпеки щодо сільськогосподарських рослин під час створення,
  дослідження та практичного використання генетично модифікованих організмів у відкритих системах на підприємствах,
  в установах і організаціях агропромислового комплексу незалежно від їх підпорядкування і форм власності;
• здійснення державного нагляду (контролю) за веденням первинного насінництва власниками майнових прав інтелектуальної власності та підтримувачами сортів рослин;
• здійснення державного нагляду (контролю) за ввезенням в Україну садивного матеріалу (насіння) незареєстрованих в Україні сортів рослин;
• здійснення державного контролю за дотриманням зерновими складами регламенту зберігання зерна та продуктів його переробки у процесі зберігання зерна та продуктів його переробки;
• здійснення державного контролю за якістю зерна та продуктів його переробки.

Стратегічним  завданням  служби   є   забезпечення   фітосанітарної   безпеки   та   виконання      міжнародних обов’язків держави.

Головне управління Держпродспоживслужби в Чернівецькій області на даний час співпрацює з 2422 суб’єктами господарювання, які здійснюють господарську діяльність, пов’язану з виробництвом та обігом об’єктів регулювання та отримують фітосанітарні послуги.

В області зареєстровано 20 деревообробних підприємств які відповідають фітосанітарним вимогам і здійснюють обробку деревини та дерев’яної тари.

В період вегетації рослин під постійним контролем фахівців управління знаходяться посіви сільськогосподарських культур та багаторічних насаджень з яких продукція вивозиться на експорт та в інші регіони країни. Перед відвантаженням об’єктів регулювання проводиться лабораторний аналіз та визначення їх фітосанітарного стану, адже продукція з області відвантажується в 23 країни світу.

Під постійним контролем спеціалістів внутрішнього карантину знаходиться імпортна продукція, яка поступає більш як із 30 країн світу. Особлива увага приділяється насіннєвому та посадковому матеріалу.

Спеціалістами Управління постійно проводяться обстеження по встановленню фітосанітарного стану області.

Одним з важливих напрямків діяльності Управління фітосанітарної безпеки є робота зі зверненнями громадян. Особлива увага приділяється  забезпеченню оперативного реагування та надання відповідей на запитання, з якими громадяни звертаються до державного органу.